Hvilke egenskaper er karakteristiske for transport-RNA. Sekundær struktur av RNA

Struktur og funksjoner til RNA

RNA- en polymer hvis monomerer er ribonukleotider. I motsetning til DNA, dannes RNA ikke av to, men av én polynukleotidkjede (unntak - noen RNA-holdige virus har dobbelttrådet RNA). RNA-nukleotider er i stand til å danne hydrogenbindinger med hverandre. RNA-kjeder er mye kortere enn DNA-kjeder.

RNA-monomer - nukleotid (ribonukleotid)- består av rester av tre stoffer: 1) en nitrogenholdig base, 2) et femkarbonmonosakkarid (pentose) og 3) fosforsyre. Nitrogenbasene til RNA tilhører også klassene pyrimidiner og puriner.

Pyrimidinbaser av RNA - uracil, cytosin, purinbaser - adenin og guanin. RNA-nukleotidmonosakkaridet er representert av ribose.

Tildele tre typer RNA: 1) informativ(matrise) RNA - mRNA (mRNA), 2) transportere RNA - tRNA, 3) ribosomalt RNA - rRNA.

Alle typer RNA er uforgrenede polynukleotider, har en spesifikk romlig konformasjon og deltar i prosessene med proteinsyntese. Informasjon om strukturen til alle typer RNA er lagret i DNA. Prosessen med RNA-syntese på en DNA-mal kalles transkripsjon.

Overfør RNA inneholder vanligvis 76 (fra 75 til 95) nukleotider; molekylvekt - 25 000–30 000. tRNA står for omtrent 10 % av det totale RNA-innholdet i cellen. tRNA funksjoner: 1) transport av aminosyrer til stedet for proteinsyntese, til ribosomer, 2) translasjonsmediator. Omtrent 40 typer tRNA finnes i cellen, hver av dem har en nukleotidsekvens som bare er karakteristisk for den. Imidlertid har alle tRNA-er flere intramolekylære komplementære regioner, på grunn av hvilke tRNA-er får en konformasjon som ligner et kløverblad i form. Ethvert tRNA har en løkke for kontakt med ribosomet (1), en antikodonløkke (2), en løkke for kontakt med enzymet (3), en akseptorstamme (4) og et antikodon (5). Aminosyren er festet til 3'-enden av akseptorstammen. Antikodon- tre nukleotider som "gjenkjenner" mRNA-kodonet. Det bør understrekes at et bestemt tRNA kan transportere en strengt definert aminosyre som tilsvarer dets antikodon. Spesifisiteten til forbindelsen mellom aminosyrer og tRNA oppnås på grunn av egenskapene til enzymet aminoacyl-tRNA-syntetase.

Ribosomalt RNA inneholder 3000–5000 nukleotider; molekylvekt - 1 000 000–1 500 000. rRNA står for 80–85 % av det totale RNA-innholdet i cellen. I kompleks med ribosomale proteiner danner rRNA ribosomer - organeller som utfører proteinsyntese. I eukaryote celler skjer rRNA-syntese i nukleolus. rRNA funksjoner: 1) en nødvendig strukturell komponent av ribosomer og dermed sikre funksjonen til ribosomer; 2) å sikre interaksjonen mellom ribosomet og tRNA; 3) initial binding av ribosomet og mRNA-initiatorkodonet og bestemmelse av leserammen, 4) dannelse av det aktive sentrum av ribosomet.

Ulike typer DNA og RNA - nukleinsyrer - er et av studieobjektene for molekylærbiologi. Et av de mest lovende og raskt utviklende områdene innen denne vitenskapen de siste årene har vært studiet av RNA.

Kort om strukturen til RNA

Så RNA, ribonukleinsyre, er en biopolymer hvis molekyl er en kjede dannet av fire typer nukleotider. Hvert nukleotid består på sin side av en nitrogenholdig base (adenin A, guanin G, uracil U eller cytosin C) kombinert med et ribosesukker og en fosforsyrerest. Fosfatrester, som forbinder med ribosene til nærliggende nukleotider, "sy" de bestanddelene av RNA til et makromolekyl - et polynukleotid. Dette er hvordan den primære strukturen til RNA dannes.

Den sekundære strukturen - dannelsen av en dobbeltkjede - dannes i noen deler av molekylet i samsvar med prinsippet om komplementaritet av nitrogenholdige baser: adenin danner et par med uracil gjennom en dobbel, og guanin med cytosin - en trippel hydrogenbinding.

I arbeidsformen danner RNA-molekylet også en tertiær struktur - en spesiell romlig struktur, konformasjon.

RNA syntese

Alle typer RNA syntetiseres ved hjelp av enzymet RNA-polymerase. Det kan være DNA- og RNA-avhengig, det vil si at det kan katalysere syntese på både DNA- og RNA-maler.

Syntesen er basert på komplementariteten til basene og antiparallelismen i leseretningen til den genetiske koden og fortsetter i flere stadier.

Først gjenkjennes RNA-polymerase og bindes til en spesiell nukleotidsekvens på DNA - promoteren, hvoretter DNA-dobbelthelixen vikler seg av på et lite område og sammenstillingen av RNA-molekylet begynner over en av kjedene, kalt malen (den andre DNA-kjeden kalles koding - det er kopien som er syntetisert RNA). Asymmetrien til promoteren bestemmer hvilken av DNA-trådene som skal tjene som mal, og lar dermed RNA-polymerasen sette i gang syntese i riktig retning.

Det neste trinnet kalles forlengelse. Transkripsjonskomplekset, som inkluderer RNA-polymerase og en uvridd region med en DNA-RNA-hybrid, begynner å bevege seg. Etter hvert som denne bevegelsen fortsetter, separeres den voksende RNA-strengen gradvis, og DNA-dobbelthelixen vikler seg av foran komplekset og settes sammen igjen bak det.

Det siste trinnet av syntesen skjer når RNA-polymerase når en bestemt region av matrisen kalt terminatoren. Avslutning (avslutning) av prosessen kan oppnås på ulike måter.

Hovedtypene av RNA og deres funksjoner i cellen

De er følgende:

• Matrise eller informasjon (mRNA). Gjennom det utføres transkripsjon - overføring av genetisk informasjon fra DNA.
• Ribosomal (rRNA), som gir prosessen med translasjon - proteinsyntese på mRNA-malen.
• Transport (tRNA). Produserer gjenkjennelse og transport av aminosyrer til ribosomet, hvor proteinsyntese skjer, og deltar også i oversettelse.
• Små RNA er en omfattende klasse av små molekyler som utfører forskjellige funksjoner under prosessene med transkripsjon, RNA-modning og translasjon.
• RNA-genomer er kodende sekvenser som inneholder genetisk informasjon i noen virus og viroider.

På 1980-tallet ble den katalytiske aktiviteten til RNA oppdaget. Molekyler med denne egenskapen kalles ribozymer. Det er ikke så mange naturlige ribozymer kjent ennå, deres katalytiske evne er lavere enn proteiner, men i cellen utfører de ekstremt viktige funksjoner. For tiden pågår et vellykket arbeid med syntese av ribozymer, som blant annet har fått betydning.

La oss dvele mer detaljert på de forskjellige typene RNA-molekyler.

Matrise (informasjon) RNA

Dette molekylet syntetiseres over den ikke-vridde delen av DNA, og kopierer dermed genet som koder for et bestemt protein.

RNA av eukaryote celler, før det i sin tur blir en matrise for proteinsyntese, må modnes, det vil si gå gjennom et kompleks av forskjellige modifikasjoner - prosessering.

Først av alt, selv på transkripsjonsstadiet, gjennomgår molekylet capping: en spesiell struktur av ett eller flere modifiserte nukleotider, hetten, er festet til enden. Det spiller en viktig rolle i mange nedstrømsprosesser og forbedrer mRNA-stabilitet. Den såkalte poly(A)-halen, en sekvens av adenin-nukleotider, er festet til den andre enden av det primære transkripsjonen.

Pre-mRNA spleises deretter. Dette er fjerning av ikke-kodende regioner fra molekylet - introner, som er rikelig i eukaryotisk DNA. Deretter skjer mRNA-redigeringsprosedyren, der sammensetningen er kjemisk modifisert, samt metylering, hvoretter det modne mRNA forlater cellekjernen.

Ribosomalt RNA

Grunnlaget for ribosomet, et kompleks som gir proteinsyntese, består av to lange rRNA-er som danner underpartikler av ribosomet. De syntetiseres sammen som et enkelt pre-rRNA, som deretter separeres under prosessering. Den store underenheten inkluderer også lavmolekylært rRNA syntetisert fra et separat gen. Ribosomale RNA-er har en tettpakket tertiær struktur som fungerer som et stillas for proteiner som er tilstede i ribosomet og utfører hjelpefunksjoner.

I den ikke-arbeidende fasen separeres ribosomunderenhetene; ved initieringen av translasjonsprosessen kombineres rRNA fra den lille underenheten med messenger RNA, hvoretter elementene i ribosomet er fullstendig kombinert. Når RNA til den lille underenheten interagerer med mRNA, strekker sistnevnte seg liksom gjennom ribosomet (som tilsvarer bevegelsen til ribosomet langs mRNA). Ribosomalt RNA til den store underenheten er et ribozym, det vil si at det har enzymatiske egenskaper. Det katalyserer dannelsen av peptidbindinger mellom aminosyrer under proteinsyntese.

Det skal bemerkes at den største delen av alt RNA i cellen er ribosomalt - 70-80%. DNA har et stort antall gener som koder for rRNA, noe som sikrer dens svært intensive transkripsjon.

Overfør RNA

Dette molekylet gjenkjennes av en viss aminosyre ved hjelp av et spesielt enzym og, i forbindelse med det, transporterer aminosyren til ribosomet, hvor det fungerer som et mellomledd i prosessen med translasjon - proteinsyntese. Overføringen utføres ved diffusjon i cellens cytoplasma.

De nylig syntetiserte tRNA-molekylene, som andre typer RNA, behandles. Modent tRNA i sin aktive form har en konformasjon som ligner et kløverblad. På "petiole" av bladet - akseptorstedet - er det en CCA-sekvens med en hydroksylgruppe som binder seg til aminosyren. I motsatt ende av "bladet" er en antikodonløkke som kobles til et komplementært kodon på mRNA. D-løkken brukes til å binde overførings-RNA til enzymet når den interagerer med aminosyren, og T-løkken brukes til å binde seg til den store underenheten av ribosomet.

Lite RNA

Disse typene RNA spiller en viktig rolle i cellulære prosesser og blir nå aktivt studert.

For eksempel er små kjernefysiske RNA-er i eukaryote celler involvert i mRNA-spleising og har muligens katalytiske egenskaper sammen med spleiseosomproteiner. Små nukleolære RNA-er er involvert i behandlingen av ribosomalt og overførings-RNA.

Små interfererende og mikroRNA er de viktigste elementene it, som er nødvendig for at cellen skal kontrollere sin egen struktur og vitale aktivitet. Dette systemet er en viktig del av cellens antivirale immunrespons.

Det er også en klasse med små RNA-er som fungerer i kompleks med Piwi-proteiner. Disse kompleksene spiller en stor rolle i utviklingen av kimlinjeceller, i spermatogenese og i undertrykkelsen av transponerbare genetiske elementer.

RNA-genom

RNA-molekylet kan brukes som genom av de fleste virus. Virale genomer er forskjellige - enkelt- og dobbelttrådet, sirkulært eller lineært. Dessuten er RNA-genomer av virus ofte segmenterte og generelt kortere enn DNA-holdige genomer.

Det er en familie av virus hvis genetiske informasjon, kodet i RNA, etter infeksjon av cellen ved omvendt transkripsjon, omskrives til DNA, som deretter introduseres i genomet til offercellen. Dette er de såkalte retrovirusene. Disse inkluderer spesielt det humane immunsviktviruset.

Betydningen av RNA-forskning i moderne vitenskap

Hvis tidligere oppfatningen om den sekundære rollen til RNA seiret, er det nå klart at det er et nødvendig og viktigste element i intracellulær livsaktivitet. Mange prosesser av overordnet betydning kan ikke klare seg uten aktiv deltakelse av RNA. Mekanismene til slike prosesser forble ukjent i lang tid, men takket være studiet av ulike typer RNA og deres funksjoner, blir mange detaljer gradvis klare.

Det er mulig at RNA spilte en avgjørende rolle i fremveksten og utviklingen av liv ved begynnelsen av jordens historie. Resultatene fra nyere studier taler til fordel for denne hypotesen, og vitner om den ekstraordinære antikken til mange mekanismer for cellefunksjon med deltakelse av visse typer RNA. For eksempel er de nylig oppdagede riboswitchene som en del av mRNA (et system med proteinfri regulering av genaktivitet på transkripsjonsstadiet), ifølge mange forskere, ekko av en epoke da primitivt liv ble bygget på grunnlag av RNA, uten deltakelse av DNA og proteiner. MikroRNA anses også for å være en veldig gammel komponent i reguleringssystemet. De strukturelle egenskapene til det katalytisk aktive rRNA indikerer dets gradvise utvikling ved å legge til nye fragmenter til det gamle protoribosomet.

En grundig studie av hvilke typer RNA og hvordan som er involvert i visse prosesser er også ekstremt viktig for teoretiske og anvendte felt innen medisin.

Fysiske og kjemiske egenskaper til DNA

Ulike faktorer som bryter hydrogenbindinger (temperaturøkning over 80 C, endringer i pH og ionestyrke, virkningen av urea osv.) forårsaker DNA-denaturering, d.v.s. endring i det romlige arrangementet av DNA-kjeder uten å bryte kovalente bindinger. Den doble helixen av DNA under denaturering er helt eller delvis delt inn i dens komponentkjeder. DNA-denaturering er ledsaget av en økning i optisk absorpsjon i UV-området til purin- og pyrimidinbaser. Dette fenomenet kalles hyperkrom effekt . Denaturering reduserer også den høye viskositeten som er iboende i native DNA-løsninger. Når den opprinnelige dobbelttrådete DNA-strukturen gjenopprettes, som et resultat av renaturering, avtar absorpsjonen ved 260 nm av nitrogenholdige baser på grunn av deres "skjerming". Dette fenomenet kalles hypokrom effekt .

"Utviklingen" av hvert DNA til dets komponentkjeder utføres innenfor et visst temperaturområde. Midtpunktet i dette intervallet kalles smeltepunktet. Smeltetemperaturen til DNA avhenger under standardbetingelser (en viss pH og ionestyrke) av forholdet mellom nitrogenholdige baser. G-C-par som inneholder tre hydrogenbindinger er sterkere, derfor, jo høyere innhold av G-C-par i DNA, jo høyere smeltepunkt.

Funksjoner av DNA. I sekvensen av nukleotider i DNA-molekyler er genetisk informasjon kodet. Hovedfunksjonene til DNA er for det første å sikre reproduksjon av seg selv i en serie av cellegenerasjoner og generasjoner av organismer, og for det andre å sikre syntese av proteiner. Disse funksjonene skyldes at DNA-molekyler fungerer som en matrise i det første tilfellet for replikasjon, dvs. kopiering av informasjon i datter-DNA-molekyler, i den andre - for transkripsjon, dvs. å omkode informasjon til RNA-strukturen.

Ris. 5 Smeltekurve (DNA-denaturering)

Komplementære DNA-tråder separert under denaturering kan under visse betingelser kobles sammen igjen til en dobbel helix. Denne prosessen kalles RENATURING. Hvis denaturering ikke har skjedd fullstendig og minst noen få baser ikke har mistet interaksjon med hydrogenbindinger, fortsetter renatureringen veldig raskt.

Cytoplasmaet til celler inneholder tre hovedfunksjonelle typer RNA. Dette er messenger-RNA – mRNA som fungerer som maler for proteinsyntese, ribosomale RNA – rRNA som fungerer som strukturelle komponenter i ribosomer, og overfører RNA – tRNA som er involvert i translasjonen (translasjonen) av mRNA-informasjon til aminosyresekvensen i proteinet.

Tabell 2 viser forskjellene mellom DNA og RNA når det gjelder struktur, lokalisering i cellen og funksjoner.

Tabell 2 Forskjeller mellom DNA og RNA

Er syntesen av et proteinmolekyl basert på messenger-RNA (oversettelse). Imidlertid, i motsetning til transkripsjon, kan en nukleotidsekvens ikke oversettes direkte til en aminosyre, siden disse forbindelsene har en annen kjemisk natur. Derfor krever oversettelse et mellomledd i form av overførings-RNA (tRNA), hvis funksjon er å oversette den genetiske koden til "språket" til aminosyrer.

Generelle egenskaper ved overførings-RNA

Transfer RNA eller tRNA er små molekyler som leverer aminosyrer til stedet for proteinsyntese (til ribosomer). Mengden av denne typen ribonukleinsyre i cellen er omtrent 10 % av den totale RNA-poolen.

Som andre typer tRNA består den av en kjede av ribonukleosidtrifosfater. Lengden på nukleotidsekvensen er 70-90 enheter, og omtrent 10 % av sammensetningen av molekylet faller på mindre komponenter.

På grunn av det faktum at hver aminosyre har sin egen bærer i form av tRNA, syntetiserer cellen et stort antall varianter av dette molekylet. Avhengig av typen levende organisme, varierer denne indikatoren fra 80 til 100.

tRNA funksjoner

Transfer RNA er leverandør av substratet for proteinsyntese, som forekommer i ribosomer. På grunn av den unike evnen til å binde seg både til aminosyrer og til malsekvensen, fungerer tRNA som en semantisk adapter i overføringen av genetisk informasjon fra formen av RNA til formen av et protein. Samspillet mellom en slik mediator og en kodende matrise, som i transkripsjon, er basert på prinsippet om komplementaritet av nitrogenholdige baser.

Hovedfunksjonen til tRNA er å akseptere aminosyreenheter og transportere dem til apparatet for proteinsyntese. Bak denne tekniske prosessen ligger en enorm biologisk betydning - implementeringen av den genetiske koden. Implementeringen av denne prosessen er basert på følgende funksjoner:

• alle aminosyrer er kodet av nukleotidtripletter;
• for hver triplett (eller kodon) er det et antikodon som er en del av tRNA;
• hvert tRNA kan bare binde seg til en spesifikk aminosyre.

Således bestemmes aminosyresekvensen til et protein av hvilke tRNA-er og i hvilken rekkefølge som komplementært vil interagere med messenger-RNA under translasjon. Dette er mulig på grunn av tilstedeværelsen av funksjonelle sentre i overførings-RNA, hvorav den ene er ansvarlig for den selektive bindingen av en aminosyre, og den andre for binding til et kodon. Derfor er funksjonene og nært beslektet.

Struktur av overførings-RNA

Det unike med tRNA ligger i det faktum at dens molekylære struktur ikke er lineær. Den inkluderer spiralformede dobbelttrådete seksjoner, som kalles stilker, og 3 enkelttrådete løkker. I form ligner denne konformasjonen et kløverblad.

I strukturen til tRNA skilles følgende stammer ut:

• akseptor;
• antikodon;
• dihydrouridyl;
• pseudouridyl;
• ytterligere.

Doble spiralstilker inneholder 5 til 7 Watson-Crickson-par. På slutten av akseptorstammen er en liten kjede av uparrede nukleotider, hvor 3-hydroksyl er festestedet til det tilsvarende aminosyremolekylet.

Den strukturelle regionen for forbindelse med mRNA er en av tRNA-løkkene. Den inneholder et antikodon som er komplementært til den semantiske tripletten. Det er antikodonet og den aksepterende enden som gir adapterfunksjonen til tRNA.

Tertiær struktur av et molekyl

"Kløverbladet" er en sekundær struktur av tRNA, men på grunn av folding får molekylet en L-formet konformasjon, som holdes sammen av ytterligere hydrogenbindinger.

L-formen er den tertiære strukturen til tRNA og består av to nesten vinkelrette A-RNA-helikser, med en lengde på 7 nm og en tykkelse på 2 nm. Denne formen av molekylet har bare 2 ender, hvorav den ene har et antikodon, og den andre har et akseptorsenter.

Egenskaper ved tRNA-binding til aminosyre

Aktiveringen av aminosyrer (deres tilknytning til overførings-RNA) utføres av aminoacyl-tRNA-syntetase. Dette enzymet utfører 2 viktige funksjoner samtidig:

• katalyserer dannelsen av en kovalent binding mellom 3'-hydroksylgruppen til akseptorstammen og aminosyren;
• gir prinsippet om selektiv samsvar.

Hver av dem har sin egen aminoacyl-tRNA-syntetase. Det kan bare samhandle med den aktuelle typen transportmolekyl. Dette betyr at antikodonet til sistnevnte må være komplementært til tripletten som koder for denne spesielle aminosyren. For eksempel vil leucinsyntetase bare binde seg til tRNA som er bestemt for leucin.

Det er tre nukleotidbindende lommer i aminoacyl-tRNA-syntetasemolekylet, hvis konformasjon og ladning er komplementære til nukleotidene til det tilsvarende antikodonet i tRNA. Dermed bestemmer enzymet det ønskede transportmolekylet. Mye sjeldnere tjener nukleotidsekvensen til akseptorstammen som et gjenkjennelsesfragment.

Ribosomalt RNA

Ribosomale ribonukleinsyrer (rRNA) er flere RNA-molekyler som danner grunnlaget for ribosomet. Hovedfunksjonen til rRNA er implementeringen av translasjonsprosessen - lesing av informasjon fra mRNA ved å bruke adapter tRNA-molekyler og katalysere dannelsen av peptidbindinger mellom aminosyrer festet til tRNA. Ribosomalt RNA utgjør omtrent 80 % av alt celle-RNA. Det er kodet av gener funnet på DNAet til flere kromosomer lokalisert i en region av kjernen kjent som den nukleolære arrangøren.

Basesekvensen i rRNA er lik i alle organismer, fra bakterier til dyr. rRNA finnes i cytoplasmaet, hvor det er assosiert med proteinmolekyler, og danner med dem celleorganeller kalt ribosomer. Proteinsyntese foregår på ribosomer. Her blir "koden" inneholdt i mRNA oversatt til aminosyresekvensen til polypeptidkjeden.

Overfør RNA

Overfør RNA, tRNA - ribonukleinsyre, hvis funksjon er å transportere aminosyrer til stedet for proteinsyntese. tRNA-er er også direkte involvert i veksten av polypeptidkjeden, og forbinder seg - er i et kompleks med en aminosyre - til mRNA-kodonet og gir konformasjonen av komplekset som er nødvendig for dannelsen av en ny peptidbinding.

Hver aminosyre har sitt eget tRNA.

tRNA er et enkeltstrenget RNA, men i sin funksjonelle form har det en "kløverblad"-konformasjon. Den har fire hoveddeler som utfører forskjellige funksjoner. Akseptor-"stilken" er dannet av to komplementært koblede terminaldeler av tRNA. Den består av syv basepar. Den 3" enden av denne stammen er noe lengre og danner en enkelttrådet region som ender i en CCA-sekvens med en fri OH-gruppe. En transportabel aminosyre er festet til denne enden. De resterende tre grenene er komplementært parede nukleotidsekvenser som avsluttes i uparrede løkkedannende regioner. Midten av disse grenene - antikodon - består av fem par nukleotider og inneholder et antikodon i midten av løkken. Antikodonet er tre nukleotider komplementære til mRNA-kodonet, som koder for aminosyren transportert av dette tRNA til stedet for peptidsyntese.

Mellom akseptor- og antikodongrenene er to sidegrener. I løkkene deres inneholder de modifiserte baser - dihydrouridin (D-løkke) og en T?C-triplett, hvor? - pseudouriain (T? C-løkke). Det er en ekstra sløyfe mellom aiticodon- og TC-grenene, som inkluderer fra 3-5 til 13-21 nukleotider.

Aminosyren er kovalent festet til 3'-enden av molekylet av enzymet aminoacyl-tRNA-syntetase, som er spesifikt for hver type tRNA.

tRNA fungerer som et mellommolekyl mellom triplettkodonet i mRNA og aminosyresekvensen til polypeptidkjeden. tRNA står for omtrent 15 % av alt cellulært RNA; disse RNA-ene har den korteste polynukleotidkjeden - den inneholder et gjennomsnitt på 80 nukleotider. Hver enkelt celle inneholder mer enn 20 forskjellige tRNA-molekyler. Alle tRNA-molekyler har en lignende grunnstruktur. I 5'-enden av tRNA-molekylet er det alltid guanin, og i 3'-enden - CCA-basesekvensen.

Nukleotidsekvensen i resten av molekylet varierer og kan inneholde "uvanlige" baser som inosin og pseudouracil.

Basesekvensen i antikodontripletten tilsvarer strengt tatt aminosyren som det gitte tRNA-molekylet bærer.

Ris. 3.

Hver aminosyre fester seg til en av sine spesifikke tRNA-er ved hjelp av enzymet aminoacyl-tRNA-syntase. Resultatet er et animacid-tRNA-kompleks, kjent som animoacyl-tRNA, der energien til bindingene mellom det terminale nukleotid A i CCA-tripletten og aminosyren er tilstrekkelig til å tillate ytterligere binding med den tilstøtende aminosyren. Dermed syntetiseres en polypeptidkjede.

En av egenskapene til tRNA er tilstedeværelsen i det av uvanlige baser som oppstår som et resultat av kjemisk modifikasjon etter inkludering av en normal base i polynukleotidkjeden. Disse endrede basene bestemmer det store strukturelle mangfoldet av tRNA-er i den generelle planen for deres struktur. Av størst interesse er modifikasjoner av basene som danner antikodonet, som påvirker spesifisiteten til dets interaksjon med kodonet. For eksempel er den atypiske basen inosin, noen ganger i 1. posisjon av tRNA-antikodonet, i stand til å komplementært kombinere med tre forskjellige tredjebaser av mRNA-kodonet - U, C og A. Siden en av egenskapene til den genetiske koden er dens degenerasjon, mange aminosyrer er kryptert av flere kodoner, som som regel er forskjellige i deres tredje base. På grunn av den uspesifikke bindingen til den modifiserte antikodonbasen, gjenkjenner ett tRNA flere synonyme kodoner.